propka3(1) on Linux
The text ecd215ff1144, as Debian 12 (Bookworm) shipped it.
predict pKa values of ionizable groups
Flags it lists
-
--alignment -
--chain -
--display-coupled-residues -
--file -
--help -
--keep-protons -
--log-level -
--mutation -
--mutator -
--mutator-option -
--pH -
--parameters -
--protonate-all -
--quiet -
--reference -
--reuse-ligand-mol2-files -
--thermophile -
--titrate_only -
--version -
-a -
-c -
-d -
-f -
-h -
-i -
-k -
-l -
-m -
-o -
-p -
-q -
-r -
-t